1991-1998 yılları arasında Avusturya Graz’da bulunan Karl Franzens Üniversitesi Tıp Fakültesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Kliniği’nde kadın hastalıkları ve doğum ihtisasını yaptı. Ayrıca buna ek olarak jinekolojik onkoloji eğitimi aldı. 1998 yılında Türkiye’ye dönerek Trakya Üniversitesi’nde 1998-2003 yılları arasında yardımcı doçent; 2003 ve 2004 yılında doçent doktor olarak görev yaptı.
Yurtiçi ve yurtdışında yaptığı çalışmalardan dolayı 2011 yılında jinekolojik onkoloji cerrahisi üst ihtisas diploması alan Doç. Dr. Fatih Güçer, çalışma yaşamının büyük bir bölümünü jinekolojik onkoloji cerrahisi ve jinekolojik endoskopik cerrahi ile ilgilenerek geçirdi. Özellikle robotik veya laparoskopik cerrahi ile hem jinekolojik kanser hem de iyi huylu jinekolojik hastalıkların tedavisi ile ilgilenen ve bu alanlar üzerine bilimsel çalışmalar yapan Doç. Dr. Fatih Güçer’in, bu zamana kadar 51 uluslararası yayınına 1300 üzerinde atıf yapılmıştır.
